為瞭解我國海洋環境變遷所導致的海洋生態系統變化，建立完整的海域生態系之背景基線資料及深化海洋基礎科學研究，是當前我國海洋永續發展之重要課題。海洋基礎生態調查研究，特別是需要利用船隻進行海上調查作業的研究項目，其調查作業成本較高，亦須視海況及船舶船期安排才能進行實海調查作業，相對提高調查研究之困難度。國家海洋研究院於110年分別與行政院農業委員會水產試驗所（以下稱水試所）及國立中山大學海洋科學院（以下稱中山大學）簽署學術合作備忘錄(MOU)，加強雙方海洋科學研究之合作。本計畫規劃本院研究人員使用(或配合)行政院農業委員會水產試驗所試驗船、國立中山大學研究船或其他單位船舶之船期，參與海上科研調查作業。研究人員隨船採集臺灣西部海域及其周邊大陸棚生態系至少2個地理區域1季次之大型底棲生物樣本（以魚類、大型甲殼類、頭足類及螺貝類為主要研究對象）與水樣，以及蒐集水文水質及底質等環境資料，並進行底棲生物群聚結構及多樣性分析，相關成果將用以逐步建置我國周邊大陸棚生態系之基礎生態基線資料，作為臺灣西部海域長期生態監測站及環境變遷影響評估之用。

(一)、 採集調查作業海域之大型底棲動物樣本，進行種類鑑定與群聚資料分析，以及海域環境資料之建
                  置與分析。     
       (二) 、使用水下探測及攝影儀器，獲取水下生物、地形及地物之照片或資料。